骨伤科创建于1959年，该科的一大特色是秉承传统中医特色，许多在现代医学看来需要手术治疗的骨科疾病在这里却能通过整复、理筋通络等中医手法治疗。在继承传统中医特色之外，骨伤科紧跟现代医学科技前沿，展现出“中医有特色、西医也一流”的新面貌。
　　骨伤科是嘉兴市针灸推拿骨伤专科的主力科室。现有副主任医师6名，主治医师4名，住院医师5名，其中硕士研究生有3名。目前该科拥有2个病区、开放床位80张。拥有飞利浦（进口）C型臂移动X线机、美国枢法膜脊椎内镜、椎间盘镜、德国蛇牌关节镜、移动X摄片机、三维正脊仪、中药熏蒸仪、激光治疗仪、双人双目手术显微镜、上下肢CPM康复仪等专科设备；配套共享设备有DSA、螺旋CT、彩色B超等。
　　该科下设脊柱外科、手足外科、关节及关节镜外科三个专科学组。开展了颈椎间盘髓核摘除椎体次全切除术治疗颈椎骨折、肿瘤等。对各类脊柱疾病采用牵引、复位、中药熏洗、开放手术等综合疗法，总有效率达90%以上。聘请了国内知名专家为顾问，运用关节镜微创技术、人工关节置换、截骨矫形及功能康复综合治疗体系，对各种关节、滑膜疾病、骨肿瘤、骨损伤等有丰富的临床经验，其中微创小切口全髋置换术系省内首家开展。开通24小时绿色通道，成功开展了断肢（指）再植；手指再造、手功能重建；各种血管、肌腱、神经损伤或缺损的修复；各种皮肤缺损的修复；外伤性及先天性手足部畸形矫治；四肢肿瘤等各种疾病的治疗等。
　　在三维正脊保守治疗腰椎间盘突出症方面，独具特色，每年治愈病患1000余例，避免了众多患者受手术之苦。在2006年全省中医骨伤年会上，该疗法得到省内专家肯定与高度评价。还采用DSA引导下治疗股骨头无菌性坏死，它是目前市内唯一一家能够独立自主开展此项手术的专科，为深受股骨头坏死之苦的患者提供了一种治疗新方法。采用中西医结合治疗肩周炎，是市科技立项项目，在临床上也获得了充分验证。
　　近三年来，骨伤科先后有《三维正脊综合治疗各型腰椎间盘突出症》、《腹部超薄皮瓣修复手部软组织缺损》、《带神经血管蒂皮瓣修复末节指腹缺损》、《中药熏洗加推拿疗法治疗骨折后期膝关节功能障碍》等十余篇科研论文在国家级、省级杂志上发表。中西医结合治疗肩关节周围炎、钉板系统及逆行交锁髓内钉治疗股骨下端骨折对膝关节功能干扰的临床对比研究，被嘉兴市科技局立项。

针灸科
　　针灸科中医特色浓郁、技术力量雄厚，在嘉兴及周边地区影响深远。该科对颈椎病、肩周炎、腰腿痛、腰突症、各种关节炎、中风偏瘫、帕金森氏病、痛经、月经不调、脑瘫等治疗效果独树一帜。该中心的冬病夏治即穴位敷贴疗法对哮喘、慢支、慢性结肠炎有良好疗效，三伏天日门诊量超过300人次。其中针刺减肥疗法，良好的疗效、无副作用等优点被称为“绿色减肥法”。